昆明南站可以实现各种交通工具的“无缝”衔接，实现了旅客进出站“零距离”换乘目标。
南站主要由南北雨棚、站房、西广场、东广场组成。两个雨棚分别位于站房的左右两侧，雨棚下边是站台和铁轨；两个广场分别位于广场的前后；站房是火车站的主体建筑，整个昆明南站的核心。
建筑规模：总面积33.66万平方米。
年发送量：计划近期为3120万人，远期可达4693万人，日均12.8万人；高峰时能达30万人。
抗震性能：八度抗震九度设防的特大型枢纽站房。
站房共有四层，分为地下层、出站层、站台层和高架层。
地下层为轨道交通1号线和4号线车站站台层。
出站层为旅客出站以及铁路与城市交通的换乘区，旅客检票出站后，可以从这里很便捷地换乘公交、地铁、旅游大巴，或去往社会车辆停车场离站。在这里，可以实现各种交通工具的‘无缝’衔接，实现了旅客进出站‘零距离’换乘目标。”
站台层为旅客上下列车的区域，并列设置沪昆、昆玉、渝昆、云桂4个车场。东西两侧为集售票、进站、综合服务、生产办公于一体的侧站房。
高架层横跨整个站场，是旅客进站层和候车层，设有进站平台、进站大厅、候车大厅及旅客服务区，小汽车、出租车等车辆可以直接到达这一层。另外，在高架层的上面设有夹层，这里设有快餐厅、咖啡厅、便利店等旅客服务设施。
发送方案：昆明南站旅客流线采用上进下出的方式，预计日均可发客12.8万人，高峰时每小时发客1.2万人，最高时可聚集1.2万人。从远期而言，到2030年每年可发送旅客4693万人。
交通换乘：昆明南站将地铁1号线、4号线引入，形成集铁路、地铁、公交、出租等市政交通设施为一体的特大型综合交通枢纽，预计2016年建成并投入运营。
昆明新南站是昆明地铁1号线呈贡支线和4号线的终点站，多个换乘点实现与其它轨道交通线路轻松接驳；车站外围交通主要有东外环中路、彩云南路、景明北路等城市主干道以及祥园南街、联大路等城市次干道，交通十分便捷。
站内道路采用上跨或下穿的方式与周边道路衔接，形成立体交通疏解。站区自西向东划分为西广场、站场、东广场三部分，西广场面向城市，是步行景观广场；东广场紧邻白龙潭山脚，为交通广场。
车站在高架层共设有四个主要入口：南北两侧入口主要服务于乘坐小型汽车到达的旅客，西侧入口侧重于服务广场和地铁旅客，东侧入口主要服务于东广场公交旅客。
